Petro, 2016'da devletle barış yapan ancak içindeki bazı grupların barışı kabul etmediği FARC'ın çatı örgütü EMC'in lideri Mordisco'nun canlı ele geçirilmesi için orduya talimat verdi.
Petro, Mordisco'nun adalet önünde hesap vermesini istediğini belirterek, eski bir militan olarak 30 yıl önce silahları bıraktıklarını ve barış sözünü yerine getirdiklerini söyledi. Cumhurbaşkanı Petro, EMC üyelerini tehdit ederek, "Ya halka hizmet yoluna girersiniz ya da devletle karşı karşıya gelirsiniz. " dedi. EMC lideri Mordisco ise Petro'ya destek verdiklerinde suçlanmadıklarını söyledi. EMC, FARC ile devlet arasındaki barış anlaşmasına hiç katılmamış ve saldırılarına devam etmişti..